Publicação
Exploring the transcriptomic profile underlying parasitic behavior in a threatened freshwater mussel
| datacite.subject.fos | Ciências Naturais::Ciências Biológicas | |
| datacite.subject.sdg | 14:Proteger a Vida Marinha | |
| dc.contributor.advisor | Gomes dos Santos, André | |
| dc.contributor.author | Lopes, Matilde Miguel Louro | |
| dc.date.accessioned | 2026-01-27T18:28:56Z | |
| dc.date.available | 2026-01-27T18:28:56Z | |
| dc.date.issued | 2025-12-10 | |
| dc.description | Dissertação de Mestrado apresentada no ISPA – Instituto Universitário para obtenção de grau de Mestre na especialidade de Biologia Marinha e Conservação | |
| dc.description.abstract | Os mexilhões de água doce da ordem Unionida Gray, 1854, estão entre os animais mais ameaçados e possuem um estágio larval parasitário único, o glochídio. Embora existam estudos morfológicos, ecológicos e histológicos em glochídios, os mecanismos moleculares subjacentes ao seu comportamento parasita permanecem pouco conhecidos. Compreender esses mecanismos é essencial para a conservação destes mexilhões. Para colmatar esta lacuna, foi gerado e analisado o primeiro transcriptoma de glochídios de Unio delphinus, Spengler, 1793, recorrendo a sequenciação por RNA-seq. O RNA foi extraído, sequenciado, processado e alinhado ao genoma recentemente publicado da espécie e a expressão de genes foi quantificada e anotada funcionalmente. Os genes com expressão >1 TPM foram submetidos a uma análise de enriquecimento para categorias de Gene Ontology e vias KEGG. Paralelamente, foi realizada uma revisão bibliográfica para identificar genes/proteínas relacionados com parasitismo noutros taxa. Foram então comparados com os dados do transcriptoma, sendo que os mais expressos estavam maioritariamente relacionados à contração muscular, à resposta ao stress, à regulação celular e à catálise lipídica. Relativamente às proteínas relacionadas com parasitismo, presentes no transcriptoma, destacam-se a fosfolipase A2, quinases e fosfatases serina/treonina, fator von Willebrand, metaloproteases, entre outras. Comparações entre estas e estudos transcriptómicos em peixes hospedeiros sugerem paralelos moleculares. Estes resultados indicam que os glochídios de Unio delphinus poderão utilizar um repertório genético coordenado para fixação, evasão imunológica e modulação fisiológica do hospedeiro. Este trabalho fornece uma base molecular para estudos futuros e estratégias de conservação específicas. | por |
| dc.description.abstract | Freshwater mussels of the order Unionida Gray, 1854, are among the most endangered animal groups and possess a unique parasitic larval stage, the glochidium. While morphological, ecological, and histological aspects of glochidia have been studied, the molecular mechanisms underlying their parasitic behavior remain poorly understood. Grasping these mechanisms is essential for the conservation of freshwater mussels. To address this gap, the first transcriptome of Unio delphinus (Spengler, 1793) glochidia was generated through Illumina RNA-seq and analyzed. RNA was extracted, sequenced, processed, and aligned to the recently published genome of the species. Gene expression was quantified and functionally annotated. Genes expressed at >1 TPM were subjected to enrichment analysis for Gene Ontology and KEGG categories. In parallel, a literature review was conducted to identify genes and proteins associated with parasitism in other taxa, which were then compared with transcriptomic data. The most highly expressed genes were mainly related to muscle contraction, stress response, cellular regulation, and lipid catalysis. Among the parasite-related proteins identified in the transcriptome, phospholipase A2, serine/threonine kinases and phosphatases, von Willebrand factor, and metalloproteases were particularly notable. Comparisons between these and transcriptomic studies in host fish suggest molecular parallels. Overall, these results indicate that Unio delphinus glochidia may employ a coordinated genetic repertoire for attachment, immune evasion, and physiological modulation of the host. This work provides a molecular foundation for future studies and species-specific conservation strategies. Keywords: | eng |
| dc.identifier.tid | 204099897 | |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/10400.12/13821 | |
| dc.language.iso | por | |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
| dc.subject | Mexilhões de água doce | |
| dc.subject | Unio delphinus | |
| dc.subject | Glochídios | |
| dc.subject | Comportamento parasita | |
| dc.subject | Sequenciação de RNA | |
| dc.subject | Freshwater mussels | |
| dc.subject | Unio delphinus | |
| dc.subject | Glochidia | |
| dc.subject | Parasitic behavior | |
| dc.subject | RNA sequencing | |
| dc.title | Exploring the transcriptomic profile underlying parasitic behavior in a threatened freshwater mussel | |
| dc.type | master thesis | |
| dspace.entity.type | Publication | |
| thesis.degree.name | Mestrado em Biologia Marinha e Conservação |